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Microbiologie
en pneumologie

Créé le 15/07/1999 Auteur : A. Taytard (Mis à jour le 28/10/2011)
     
     

On considère que les voies respiratoires d'un sujet sain non fumeur sont stériles.
En fait il y existe une flore bactérienne très semblable de celle des voies aériennes sus-glottiques mais à des concentrations très inférieures et qui diminuent de la glotte à l'alvéole.
On considère que la contamination se fait par micro-aspirations.

Réf :
Charlson ES, Bittinger K, Haas AR, Fitzgerald AS, Frank I et al. Topographical continuity of bacterial populations in the healthy human respiratory tract. Am J Respir Crit Care Med 2011;184:957-63


      
Expectoration (examen cytobactériologique des crachats : ECBC)
Difficile (contamination salivaire)
  critères de qualité : prélèvement : > 25 neutrophiles et < 5 cellules épithéliales par champ
 

on ne retient que les bactéries largement prédominantes (numération des germes : > 107/mL) et retrouvées en culture.

  On peut s'aider de
  kinésithérapie de drainage
  expectoration provoquée : nébulisations de solutions hypertoniques (contre-indication : hyper-réactivité  bronchique)
  cas particulier : mucoviscidose : bactériologie positive pour les germes : > 102/mL
Pas d'intérêt sauf
  hospitalisation
  si le patient reçoit déjà des antibiotiques
  si sévérité, pour le cas où l'antibiothérapie initiale serait inefficace
  si on s'attend à un Pneumocoque résistant
  mycobactéries
  aspergillus
   légionnelles
 
Endoscopie bronchique
aspiration simple : bactériologie positive pour les germes : > 105/mL
avec lavage bronchiolo-alvéolaire : bactériologie positive pour les germes : > 104/mL
avec brosse protégée : bactériologie positive pour les germes : > 103/mL
indiquée dans tous les cas où la connaissance du germe est nécessaire.
      
Autres
ponction trans-trachéale
ponction trans-thoracique
biopsie chirurgicale
      
Hémoculture
      
Sérologie
      
Recherche d'antigènes bactériens (pneumocoque, légionnelle)
     
Cas particuliers : 
la tuberculose
les mycobactéries atypiques

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